马全钦出生于1901年,名廷斌,马国良长子。少时读“四书”“五经”,年稍长即在凉州西军任职。直系军阀曹辊任总统时,任命马全钦为-侍从武官,在京供职。民国十五年(1926年)冯玉祥国民军入甘,将西北军改编为国民军暂编二十七师,马全钦任团长,驻防导河(今临夏)。民国十七年(1928)马仲英起事,马步芳亦约马全钦共同起事,马全钦临时改变主意,劝阻马步芳,并攻打马仲英部失利后返回大河家,撤毁四堡子兵器库后前往兰州。马步芳主持青海军政后对马全钦言听计从,信任有加。
民国二十二年(1933)孙殿英任西北屯垦督办,“三马”拒孙,兵力吃紧,宁夏马鸿逵请马全钦出任所部骑兵第二旅旅长,人称“尕旅长”,击败孙殿英后因得不到重用,遂辞官回家,在大河家兴办教育。民国二十五年(1936)创办“青海回族教育促进会循化分会附设临夏地区私立魁峰小学”,从青海聘请教师任教。民国二十九年(1940)将魁峰小学迁入新址,学校原场院中又创办魁峰女子小学。1943年创立“魁峰中学”。马全钦还开办三所完小、八所四年制初小。
1942年马全钦应聘任朱绍良第八战区高级参谋,1948年任国民党中央-。1949年8月22日临夏解放,马步芳感到大势已去,溃逃前命马全钦烧毁渡船以阻止解放军西进,马全钦拒绝并携全家至青海官亭暂避,与弟马介钦收缴马步芳一个团的军械、物资向解放军投诚,并派遣马介钦、马显锐、孔宪章、陈奎、赵吉堂、马光武等一行十三人为代表,带其亲笔信,前往临夏面见王震将军。经王震司令员推荐,马全钦被任命为中国人民解放军第一兵团高级参谋。为支援解放军渡黄河西进青海,马全钦捐献牛皮袋80余条,并和马丕烈、马辅臣、徐季直、水梓等组成“临夏和平代表团”,随军赴西宁,与国民党军政人员座谈,以求和平解放青海,并写信给新疆骑五军军长马呈祥,劝其和平起义。建国后马全钦任西北军政委员会高级参谋,1952年调任西北行政区民族事务委员会委员,后任全国回民文化协会委员,1964年调任宁夏自治区参事室参事。“文革”中被遣送回家,1976年后恢复名誉,并当选为甘肃省政协委员,1981年病逝于兰州,享年八十一岁。